La definición clásica de mejoramiento genético animal establece que este “…consiste en aplicar principios biológicos, económicos y matemáticos, con el fin de encontrar estrategias óptimas para aprovechar la variación genética existente en una especie de animales en particular para maximizar su mérito”.

La Alpaca es un animal productor de pelo fino y su fibra es considerada entre  las “Nobles” junto al Cashmere, Angora, Camello, etc.  Sin embargo, su precio en el mercado internacional es inferior a estas. Una de las razones que explica este fenómeno es la inmensa variación que existe entre las diferentes calidades de fibra de Alpaca las cuales se encuentran generalmente en un mismo animal. Hay fibras gruesas (hasta 40 micrones) y fibras muy finas (desde 14.5 micrones).

El mejoramiento genético que se lleva a cabo en el fundo Pacomarca está dirigido a establecer un tipo de animal que conserve la mejor finura de la fibra de Alpaca pero al mismo tiempo reduzca considerablemente su variabilidad y elimine en la medida de lo posible las cerdas ó pelos de más de 30 micrones, prescindiendo a la vez de los pelos contaminantes de otro color diferente al del animal (las canas). Para ello se utilizan los instrumentos tecnológicos más modernos y la metodología genética de vanguardia para lograr el objetivo y poder, posteriormente, diseminar los animales deseados entre los miles de productores Altoandinos.  El avance logrado hasta el momento es notable.